Мы задавали вопрос по этому поводу на сайте Онлайнинспекции, и нам ответили, что если отпуск использован авансом, то на следующий рабочий год в графике отпусков следует предусмотреть то количество дней отпуска, на которое работник будет иметь право ( https://xn--80akibcicpdbetz7e2g.xn--p1ai/questions/view?id=115739 ).

Получается, можно в следующем графике отпусков запланировать работнику отпуск 21 день вместо 28. Но, конечно, если работник решит уволиться раньше, чем отработает предоставленный авансом отпуск - может не получиться взыскать с него всю сумму выплаченных авансом отпускных.

Порядок досрочного выхода работника из отпуска без сохранения заработной платы законодательством не урегулирован. Отдельные суды отмечают, что законодательство не содержит норм, запрещающих работнику досрочно прервать отпуск без сохранения зарплаты. Наличие у работника права на прерывание отпуска без сохранения зарплаты предполагает обязанность работодателя в случае поступления к нему подобного заявления принять соответствующий акт (Апелляционное определение Верховного суда Республики Марий Эл от 24.12.2013 по делу N 33-2281/2013; Определение Санкт-Петербургского городского суда от 14.02.2011 N 33-1997/2011). Полагаем, наименее рискованный вариант в такой ситуации - принять от работника заявление и прервать отпуск.

По мнению представителей Роструда России это не допустимо, так как режим ненормированного рабочего времени устанавливается в отношении всех работников (а не в отношении их части), занимающих одноименную должность (см. разъяснения: https://xn--80akibcicpdbetz7e2g.xn--p1ai/questions/view/120597 )